四川生猪重大疫病监测与防控工程研究中心是集生猪疫病防控、生猪健康养殖和猪肉食品安全监测以及相关前沿科学研究为一体的工程研究中心，也是学校本专科生和研究生的重要实践基地。中心于2019年1月顺利通过四川省农业农村厅、四川省动物疫病预防控制中心和绵阳市动物疫病预防控制中心组成的专家组对实验室的现场评审和考核，成功获得了四川省农业农村厅批准的非洲猪瘟病毒病原分子生物学第三方检测实验室资质（川农函【2019】81号），并于2019年12月获四川省教育厅批准立项为省级工程研究中心（川教函【2019】621号）。
中心主要研究方向为：生猪疫病防控与新型疫苗开发、生猪健康养殖与食品安全监测、养殖废弃物处理与资源化利用。中心紧紧围绕服务地方畜牧业健康发展和保障食品安全的工作目标，积极参与川西北地区非洲猪瘟（ASF）、经典猪瘟（CSF）、猪蓝耳病（PRRS）、猪流行性腹泻（PED）、猪伪狂犬（PR）等重大生猪疫病防控、开展生猪健康养殖技术培训、参与省市重大生猪疫情会商和食品安全隐患排查、指导国家生猪产业技术体系绵阳综合试验站的CFS、PR净化并获农业部“疫病净化示范场”授牌等，为地方经济发展提供了重要的技术支撑和人才支持。截止2020年9月，中心承担国家、省、市等各级科研项目50余项，参加国际会议10余人次，参加国内学术交流30余人次，在国内外发表学术论文60余篇，主编、参编专著或教材3部，申报国家发明专利6项，获科技成果奖5项。
中心通过项目合作、技术交流、人才培养等多种形式，长期与四川大学、四川农业大学、华中农业大学、西北农林科技大学、铁骑力士集团、正大集团、希望集团、百诺吉生物等20余家企事业单位保持着良好的合作关系，促使中心科研能力和水平不断提升，社会服务能力显著增强。中心每年为地方企事业单位开展专业技术培训10余场次，为绵阳、德阳、广元、遂宁等地区30余个大中型养殖场、兽药、疫苗、饲料、食品等生产企业及加工企业提供样品检测和技术咨询，为川西北生猪健康养殖和猪肉品质的提升提供了重要的技术支撑。
中心坚持走产、学、研、用结合之路，力争通过3-5年努力，将中心建设成为西部具有重要影响力的集生猪疫病防控与健康养殖关键技术研究、科技产品开发、科技合作与交流的工程技术研究中心和人才培养基地，整体达到西部一流、国内先进的生猪重大疫病防控技术平台和成果转化集成创新平台。